Tổ chức áo đen đã bị tiêu diệt sau 2 năm kể từ khi conan xuất hiện. Vốn dĩ là sau khi tiêu diệt là sẽ có thuốc giải nhưng mọi thông tin về thuốc giải đã bị tiêu hủy từ trước. Kiến cho việc chế tạo thuốc giải trở nên vô vọng.

Conan đã chấp nhận là mình sẽ không thể quay trở lại cơ thể cũ và mãi mãi không cho Ran biết cậu là shinichi.

-Vậy cháu chắc chắn là sẽ tiếp tục sống với thân phận là conan sao? ( bác Agasa hỏi lại ) 

-Vâng, và cháu sẽ không cho Ran biết được cháu là shinichi. ( Conan trả lời một cách chắn chắn )

-Bác hiểu rồi, nhưng cháu định để Ran tiếp tục chờ đợi hay sao?

-Cháu sẽ gặp Ran lần cuối dưới thân phận là Shinichi và nói lời tạm biệt với cậu ấy

-Thôi, quyết định của cháu bác không thể xen vào. Bác biết là cháu làm vậy là để cho Ran được hạnh phúc.

-Cảm ơn vì đã hiểu cho cháu bác tiến sĩ.

Cả Hai người cứ nói chuyện với nhau mà không để ý tới một cô gái với mái tóc nâu đỏ đã nghe hết mọi chuyện. Đó là Haibara, cô đứng suy nghĩ một lúc rồi lặng lẽ xuống phòng thí nghiệm.

---------Vài ngày sau--------

Conan đã xuất hiện dưới thân phận Shinichi và nói lời chào tạm biết tới Ran.

-Ran à, cậu phải thật hạnh phúc bên người khác nhé. Tớ không thể tiếp tục để cậu phải chờ đợi nữa. Hứa với tớ nhé, được không? ( cậu nói với giọng buồn bã )

-Tớ hiểu mà cậu cũng phải sống tốt nhé Shinichi ( Ran cũng buồn không kém gì cậu )

-Ừm, mà ngôi nhà của giao lại cho Conan rồi, vì mẹ tớ vừa nhận Conan làm con nuôi. THằng bé nó nói với tớ là chừng nào nó lớn thì nó sẽ sống ở ngôi nhà đó đấy nha.

-Tớ biết rồi, Conan cũng sống tự lập lắm nên chắc thằng bé sống ở đó cũng được.

 ......

Sau buổi nói chuyện đó thì mọi thứ cũng trở lại như bình thường. Cậu vẫn tiếp tục đi học với lại đội thám tử nhí.

Một hôm, đội thám nhí gồm Ayumi, Mitsuhiko và Genta lúc đang trên đường về lại kéo cậu lại hỏi:

-Nè Conan-kun cậu có biết là tại sao AI-chan lại nghỉ mấy bữa nay không ( Ayumi hỏi về tình hình cô bạn của mình )

-Tớ cũng không biết nữa, mấy bữa nay tớ không qua nhà bác tiến sĩ nên không biết gì hết ( Conan trả lời )

-Vậy cậu thử qua nhà bác tiến sĩ thử xem. ( Mitsuhiko cũng lo cho Haibara )

-Rồi biết rồi, tớ sẽ qua coi thử.

Nói rồi cậu đi qua nhà bác tiến sĩ.

Vừa tới nơi, cậu chưa kịp mở của thì bác tiến sĩ đã đứng trước mặt.

-Ồ, Conan-kun à. Bác đang định đi tìm cháu mà cháu đã tới rồi.

-Có chuyện gì dậy bác tiến sĩ. Cháu tới xem thử Haibara có chuyện gì mà mấy bữa nay không đi học ấy.

-Thì cũng là chuyện của bé Ai đó. Mấy bữa nay con bé nó cứ ở trong phòng thí nghiệm mấy ngày nay à ( Cậu lo lắng hỏi )

-Đúng vậy, thôi cháu vào trong khuyên con bé ra ngoài đi.

Cậu bước vào nhà rồi chạy một mạch xuống phòng thí nghiệm. Cậu gõ cửa phòng rồi kêu:

-Haibara à, cậu nghe mình ra ngoài đây đi.

-Cậu đi đi.....tôi vẫn ổn.....cậu không phải lo lắng cho tôi. ( Haibara ở trong phòng yếu ớt nói vọng ra )

Cậu nghe thấy giọng của cô vọng ra yếu ớt như vậy cậu vội lấy chìa khoá mở cửa phòng.

Trong phòng, cậu thấy hình bóng người con gái tóc nâu đỏ đang ngồi trước mà hình máy tính một cách mệt mỏi.

-Cậu.....vào đây làm gì.....đi ra đi.

-Này, cậu có sao không vậy.

Cô định đi tới đảy cậu ra ngoài, nhưng chưa tới nơi thì ngã gục xuống rồi ngất xỉu.

-Haibara! Cậu bị sao vậy, tỉnh lại đi!